Do không còn nhiều cơ hội cạnh tranh top 4 Ngoại hạng Anh nên Arsenal tập trung toàn lực cho trận đấu này. HLV Unai Emery sử dụng đội hình gần như mạnh nhất ông đang có, ngoại trừ sự thay đổi nhỏ ở vị trí thủ môn khi Petr Cech được bắt chính thay vì Bernd Leno. Trong khi đó, Valencia chơi với đội hình có thiên hướng tấn công cao hơn trước khi hai tiền đạo Kevin Gameiro và Rodrigo đều ra sân ngay từ đầu. Đây là điều dễ hiểu vì Valencia đang bị dẫn trước 1-3 sau trận lượt đi.
Với lợi thế sân nhà và tinh thần quyết thắng, Valencia tràn lên tấn công ngay từ đầu và họ nhanh chóng tìm được bàn mở tỉ số nhờ công Kevin Gameiro ở phút 11. Tuy vậy, niềm vui của Valencia chỉ kéo dài được 6 phút trước khi Aubameyang lập siêu phẩm đưa trận đấu về thế cân bằng. Những phút tiếp theo, Arsenal chủ động chơi phòng ngự phản công khiến Valencia rơi vào thế bế tắc. Tỉ số 1-1 được giữ hết hiệp đầu tiên.

Phút 69, Aubameyang giúp Arsenal tái lập thế dẫn bàn sau pha băng cắt đệm bóng cận thành đẹp mắt. Đến phút 88, tiền đạo người Gabon hoàn tất hat-trick với pha dứt điểm cực mạnh từ góc hẹp, qua đó ấn định chiến thắng 4-2 cho Arsenal. Sau hai lượt trận, Arsenal giành chiến thắng chung cuộc với tỉ số 7-3, qua đó giành vé vào chung kết.
Đối thủ của Arsenal trong trận chung kết Europa League là Chelsea, đội đã đánh bại Frankfurt trên chấm luân lưu 11m trong trận bán kết cùng giờ.